如何配置超级计算机

如何配置超级计算机

把各种部件连成一台完整的超级电脑的方法如下：

1.首先要确定硬件部件和所需要的资源

需要一个头节点（head node），至少一打的计算节点（compute node），一台以太网交换机，一个电源分配单元（power distribution unit）和一个服务器机架。计算一下电力消耗，冷却需求和占地需求。同样，你需要确定你的私有网络的IP地址段，节点的命名，预计使用的软件包以及搭建 服务集群所用的技术（后面会有更多解释）。

2.建立计算节点

需要自己组装计算节点，或者你也可以使用预配置的服务器。

●选择一款能够最大化空间、冷却和能源消耗效率的机架式服务器；

●或者，可以使用一打左右闲置的过时服务器——它们集合在一起工作的性能要比它们独立运行时的总和还多，而且还能省你一大笔钱！整个系统的处理器、网络适配器、主板应该是同一型号的，这样才能达到最佳运行效能。当然了，还要给每个节点配内存和硬盘，并且至少给头节点配一台光驱。

3.将服务器装在机架上

安装的时候从下面开始，这样可以避免机架头重脚轻。你可能会需要朋友的帮助才能完成这件事——这么多的服务器将非常的重，把它们放到机架的滑轨上会非常困难。

4.在机架顶端安装以太网交换机

现在来配置交换机：允许9000字节的大的帧，将IP地址设置为你在第一步里面确定的静态地址，关闭例如SMTP嗅探这样不必要的路由协议。

5.安装能源分配单元

根据目前你的节点的最大需求，可能220V就能满足你的高性能计算需求了。

6. 一切都安装妥当之后，就可以开始配置环节了

Linux是高性能计算集群（HPC Cluster）操作系统的事实标准，这不仅因为Linux是科学计算的理想环境，也是由于在数以百计甚至千计的节点上安装的时候，Linux不会产生任何花费。设想一下，在如此多的节点上安装Windows会花掉你多少钱呢？

●从更新主板BIOS的固件开始，将所有节点的BIOS固件都更新至最新的版本；

●在每个节点上都安装好你喜欢的Linux发行版，头节点需要安装队图形界面的支持。比较流行的选择，包括CentOS、OpenSuse、Scientific Linux、RedHat以及SLES；

●使用Rocks Cluster Distribution来搭建计算集群。除了它已经安装好计算集群需要使用的所有工具外，Rock还提供了一种通过PXE和RedHat的“Kick Start”来进行批量部署的方案。

7. 安装消息传送界面、资源管理器以及其他必须的库

如果上一步里你没有选择Rock做为你的节点的操作系统，那么现在你需要手动设置并行计算机制所必需的软件。

●首先，你需要一个便携的bash管理系统，例如Torque Resource Manager，这些软件允许你划分以及分配计算任务；

●如果安装了Torque Resource Manager，那么你还需要Maui Cluster Scheduler来完成设置；

●其次，需要安装消息传送界面（message passing interface），用来在不同的计算节点的进程之间共享数据。

最后，不要忘了用多线程的数学库及编译器来编写计算任务。

8.将所有的计算节点接入网络

头节点负责将任务分配到计算节点，计算节点再把结果返回回来，节点间的消息传递也是如此，所以当然是越快越好了。

●使用私有网络将集群中的所有节点互联起来；

●头节点其实还充当局域网里的NFS、PXE、DHCP以及NTP服务器；

●将该网络从公网中分离出来，这样可以保证该网络中的广播报文不会影响到其他的网络；

9.对集群进行测试

在你把你强大的Top500计算集群交付给客户之前，你还要测试一下它的性能。HPL（High Performance Lynpack）评测软件包是测试集群的计算速度的常见选择。你需要从源代码编译它，编译的时候根据你选择的架构，打开所有可能的优化选项。